Ένα μεγάλο θρακικό ιερό ανακάλυψαν οι αρχαιολόγοι του Εθνικού Ιστορικού Μουσείου στο νησί του Αγίου Θωμά, κοντά στη Σωζόπολη. Στη δυτική ακτή του νησιού, η ομάδα ανακάλυψε δύο τελετουργικούς λάκκους από την Ύστερη Εποχή του Σιδήρου, αλλά πιθανότατα ο αριθμός τους είναι μεγαλύτερος. Χρησιμοποιήθηκαν από τους Θράκες μετά τον 5ο αιώνα π.Χ., όπως αποδεικνύουν τα θραύσματα ελληνικών αμφορέων που βρέθηκαν. Τα ευρήματα αποδεικνύουν ότι στην περιοχή υπήρχε ένα μεγάλο ιερό. Η περιοχή είχε επιλεγεί μια και από εκεί πέρναγε ο αρχαίος δρόμος από τη Σωζόπολη προς την Κωνσταντινούπολη. Η πρώτη επίσημη αποστολή στο νησί του Αγίου Θωμά έγινε το 1955 και αποκάλυψε τα θεμέλια μιας μικρής εκκλησίας και μερικά επιπλέον κτίρια. Σύμφωνα με τους αρχαιολόγους, πρόκειται για τα ερείπια μιας μονόκλιτης εκκλησίας. Στην κορυφή του νησιού, οι αρχαιολόγοι του ΕΙΜ ανακάλυψαν και ένα μεσαιωνικό μοναστήρι.