Zyra e Revizionit konstatoi të meta në administrimin e rrjetit NATURA 2000. Legjislacioni bullgar nuk është i harmonizuar me Direktivat 92/43/EIO  и 2009/147/ЕО për ruajtjen e habitateve të natyrshme dhe të florës dhe faunës së egër. Ministri i Mjedisit dhe Ujërave nuk ka dhënë urdhra për aplikimin e 211 prej gjithsej 341 zonave të mbrojtura dhe nuk ka caktuar regjim për ruajtjen e tyre. Prandaj Komisioni Evropian filloi një procedurë penale kundër Bullgarisë. Për shkak të moszbatimit të politikës për ekologjinë të BE-së ka risk nga përdorimi i padrejtë i mjeteve publike. Kanë pësuar dëme dhe pronarët e pronësive në zonat e mbrojtura. U janë dhënë nja 9 rekomandime Ministrisë së Mjedisit dhe Ujërave dhe Ministrisë së Bujqësisë për aplikimin e NATURA 2000.