От Обществения съвет от квотата на НПО и медии се притесняват също, че всичко това цели да смени директора на Фонда или самият фонд да премине към администрацията на МЗ.
Мария Чернева, журналист от БНТ от квотата на обществените медии, заяви:
Защо имам съмнение, че са вдигнали мерника на Фонда? Защото една от така подхвърлените идеи беше – дали не е по-добре Фондът да бъде закрит и функциите му да се поемат от администрацията на МЗ? Ами не, не е по-добре. Администрацията на Фонда е хиперспециализирана в нещо много конкретно. Ако мине към администрацията на МЗ, вярвайте ми, ще има големи сътресения.
Досега неразплатените средства към Фонда като задължения към лечебните заведения в България са 586 428 хиляди лева, към "България Еър" по договор за обществена поръчка - 31 000 лева, към клиники в чужбина - 1,782 милиона лева. Бюджетът на Фонда за 2015 г. е 12 млн. лева, а от началото на годината са изразходвани 9 милиона лева.